AlphaFold3架构详解 (elanapearl.github.io)

本文以图解的方式详细介绍了AlphaFold3的架构，包括输入准备、表征学习和结构预测三个主要部分。文章解释了如何将分子序列转化为模型输入、如何利用多序列比对和结构模板进行检索增强生成、以及如何使用基于三角形操作的Pairformer模块和条件扩散模型进行结构预测。此外，文章还讨论了损失函数、置信度预测、循环机制和交叉蒸馏等训练细节，并从机器学习趋势的角度对AlphaFold3的设计选择进行了分析。