Un supercalculateur dessine le plan moléculaire pour réparer l'ADN endommagé

Des scientifiques ont utilisé le supercalculateur Summit pour simuler le complexe pré-incision (PInC), un composant crucial de la voie de réparation par excision de nucléotides (NER). NER est un mécanisme moléculaire complexe qui répare l'ADN endommagé en trois étapes : reconnaissance, vérification et réparation. Chaque étape implique différents complexes protéiques. Les chercheurs ont construit un modèle 3D du PInC en utilisant diverses techniques biophysiques et AlphaFold2 pour la prédiction de structure, puis ont utilisé des simulations de dynamique moléculaire pour révéler ses propriétés dynamiques et ses mécanismes fonctionnels. Cette recherche éclaire les troubles génétiques liés à NER, tels que le xeroderma pigmentosum et le syndrome de Cockayne, et fournit des informations cruciales pour le développement de nouveaux traitements.