分子动力学模拟:从理论到实践

2025-06-10
分子动力学模拟:从理论到实践

本文深入浅出地讲解了分子动力学(MD)模拟的原理和实践。从蛋白质折叠的例子出发,解释了力场、能量最小化、平衡化和生产模拟等步骤,并探讨了量子效应、增强采样和自由能计算等高级主题。文章还分析了两个案例研究,展示了MD模拟在药物发现和病毒适应性研究中的应用,并指出了MD模拟的局限性和未来发展方向。