Dinâmica Molecular: Um mergulho profundo da teoria à prática
2025-06-10
Este artigo fornece uma visão geral abrangente das simulações de dinâmica molecular (DM), explicando os princípios subjacentes e as aplicações práticas. Usando o enovelamento de proteínas como exemplo central, ele detalha as etapas envolvidas: campos de força, minimização de energia, equilibração e simulações de produção. Tópicos avançados como efeitos quânticos, amostragem aprimorada e cálculos de energia livre também são explorados. Dois estudos de caso demonstram o uso da DM na descoberta de medicamentos e na pesquisa de adaptação da influenza. O artigo conclui destacando as limitações e as direções futuras das simulações de DM.