Dynamique Moléculaire : Plongeon en profondeur de la théorie à la pratique

2025-06-10
Dynamique Moléculaire : Plongeon en profondeur de la théorie à la pratique

Cet article fournit un aperçu complet des simulations de dynamique moléculaire (DM), en expliquant les principes sous-jacents et les applications pratiques. En utilisant le repliement des protéines comme exemple central, il détaille les étapes impliquées : les champs de force, la minimisation de l’énergie, l’équilibration et les simulations de production. Des sujets avancés tels que les effets quantiques, l’échantillonnage amélioré et les calculs d’énergie libre sont également explorés. Deux études de cas démontrent l’utilisation de la DM dans la découverte de médicaments et la recherche sur l’adaptation de la grippe. L’article conclut en soulignant les limites et les orientations futures des simulations de DM.