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蛋白质语言模型综述 (www.apoorva-srinivasan.com)

这篇文章回顾了蛋白质语言模型的最新进展。作者将蛋白质序列比作人类语言,并解释了如何利用Transformer模型来理解和生成蛋白质序列。文章重点介绍了编码器模型、解码器模型以及条件Transformer模型,并详细阐述了这些模型在蛋白质工程中的应用,例如蛋白质结构预测、功能预测和蛋白质设计。此外,文章还讨论了蛋白质语言模型的规模效应,指出随着模型规模和数据集的增大,模型的性能会显著提升。文章最后总结了该领域的挑战和未来方向,强调了模型可解释性和生物学知识整合的重要性。