AlphaFold 的新成果是奇迹还是海市蜃楼？ (olegtrott.substack.com)

本文作者对DeepMind最新发布的AlphaFold 3持怀疑态度。作者指出，AlphaFold 3在药物分子与靶蛋白结合预测方面取得了优于AutoDock Vina的结果，但其测试数据集存在大量冗余，这可能导致模型只是简单地记住了训练数据，而非真正理解了分子间相互作用。作者还对AlphaFold 3预测结果中出现的原子重叠问题表示担忧，认为这表明模型可能缺乏对基本化学原理的理解。