Supercomputadora traza el plano molecular para reparar el ADN dañado
Científicos utilizaron la supercomputadora Summit para simular el complejo pre-incisión (PInC), un componente crítico en la vía de reparación por escisión de nucleótidos (NER). NER es un mecanismo molecular complejo que repara el ADN dañado en tres etapas: reconocimiento, verificación y reparación. Cada etapa implica diferentes complejos proteicos. Los investigadores construyeron un modelo 3D del PInC utilizando varias técnicas biofísicas y AlphaFold2 para la predicción de la estructura, y luego emplearon simulaciones de dinámica molecular para revelar sus propiedades dinámicas y mecanismos funcionales. Esta investigación arroja luz sobre los trastornos genéticos relacionados con NER, como el xeroderma pigmentoso y el síndrome de Cockayne, y proporciona información crucial para el desarrollo de nuevos tratamientos.