AlphaFold3架构详解

2024-07-13

本文以图解的方式详细介绍了AlphaFold3的架构,包括输入准备、表征学习和结构预测三个主要部分。文章解释了如何将分子序列转化为模型输入、如何利用多序列比对和结构模板进行检索增强生成、以及如何使用基于三角形操作的Pairformer模块和条件扩散模型进行结构预测。此外,文章还讨论了损失函数、置信度预测、循环机制和交叉蒸馏等训练细节,并从机器学习趋势的角度对AlphaFold3的设计选择进行了分析。

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