Zstandard长距离模式：基因组压缩的惊喜
2025-09-15
Zstandard的--long模式通过扩大搜索窗口，显著提升了对大型文件的压缩效率。在一项针对包含661,405个细菌基因组的2.6Tbp数据集的测试中，默认Zstandard压缩比仅为3，而开启--long模式后，压缩比提升至4。然而，通过移除fasta文件内的换行符后，压缩比飙升至31，达到了接近专业DNA压缩工具的水平，压缩文件大小缩减至80GB。虽然压缩时间略有增加，但这种效率提升对于处理大型基因组数据而言，是一个极具价值的优化。
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