Supercomputer zeichnet molekulare Blaupause für die Reparatur beschädigter DNA

Wissenschaftler haben den Summit-Supercomputer verwendet, um den Präinzisions-Komplex (PInC), eine kritische Komponente im Nukleotid-Exzisionsreparaturweg (NER), zu simulieren. NER ist ein komplexer molekularer Mechanismus, der beschädigte DNA in drei Schritten repariert: Erkennung, Verifizierung und Reparatur. Jede Stufe umfasst verschiedene Proteinkomplexe. Die Forscher erstellten ein 3D-Modell des PInC mithilfe verschiedener biophysikalischer Techniken und AlphaFold2 zur Strukturvorhersage und führten dann Molekulardynamiksimulationen durch, um dessen dynamische Eigenschaften und Funktionsmechanismen aufzudecken. Diese Forschung wirft Licht auf genetische Störungen im Zusammenhang mit NER, wie Xeroderma pigmentosum und Cockayne-Syndrom, und liefert wichtige Erkenntnisse für die Entwicklung neuer Behandlungen.